La couleur des perles est semblable à celle de la nacre du coquillage sécréteur. Le plus souvent d'un blanc rosé (perles d'Orient), elles peuvent être aussi blanches tirant sur le jaune, voire dorées (perles pipi de Tahiti) et même grises plus ou moins foncées (perles grises, perles noires de Tahiti ou du Mexique). 
